科技日报昆明8月23日电 （记者赵汉斌）记者23日从中国科学院昆明动物研究所获悉，该所张亚平院士团队牵头，系统整合基因组、转录组、表观基因组和三维基因组信息，构建了家猪三维调控基因组数据库“猪矩阵”，为解析猪非编码调控机制、复杂性状演化及猪与人比较生物学研究提供了一站式平台。相关成果发表在国际期刊《分子生物学与演化》上。

随着全基因组测序技术发展，大量与猪驯化、经济性状相关的遗传变异被发现，但许多关键变异位于不编码蛋白质的非编码区域，传统基因组注释难以揭示这些调控变异究竟作用于哪些基因。

为解决这一难题，“猪矩阵”收录了来自8头遗传和表型信息明确的94份家猪生物学样本，覆盖4个发育时期、11种组织器官及3种细胞系，共整合16种文库类型的1170套实验数据，涵盖全基因组甲基化测序、转录组测序、单细胞核转录组测序、全基因组测序等数据。

由于数据来自统一的样本体系和实验流程，该数据库最大程度地减少了批次差异。区别于传统线性基因组注释数据库，“猪矩阵”通过整合染色质开放状态、组蛋白修饰和三维互作信息，不仅能查询候选顺式调控元件，还能将其连接到潜在的近端和远端靶基因，实现从调控元件到靶基因的系统追踪。

数据库内置了三维基因组可视化工具，可同步展示染色体互作热图、染色质高级结构及多种表观组学信号。